SMS cuenta con dos singulares técnicas para caracterizar la superficie y la estructura cristalina de un cristal o de un material conductor. Desde un punto de vista únicamente superficial contamos con el microscopio de efecto túnel STM, que permite obtener imagenes con resolución atómica, es decir ver los átomos, o más concretamente, el resultado de la interacción de transferencia de carga entre los átomos de la superficie y los de la sonda de muestreo, la punta. Las imagenes de STM, además de espectaculares, por su realismo son muy importantes, ya que nos permiten "ver", que es lo que pasa con las superficies, como se ordenan los atómos en un universo de dos dimensiones.