SMS cuenta con dos barras de transferencias magnéticas. La primera de ellas, lleva acoplado una pinza "macho", igual que la barra mecánica. Esta barra se emplea para pasar la muestra desde la cámara de introducción de muestras a la cámara XPS. Además, en esta barra se sujetan las puntas del STM, en las que se va a realizar la técnica de field emission. La otra barra magnética lleva una pinza "hembra", que se utiliza para coger la muestra desde la barra mecánica y llevarla al STM.